鹽酸羥胺是一種無機強酸，在工業加工中有著廣泛的應用，例如金屬的精煉。鹽酸羥胺往往能夠決定產品的質量。利用鹽酸羥胺可以與難溶性堿反應的性質，制取潔廁靈、除銹劑等日用品。在明膠、食品、食品原料和食品添加劑的生產中常用到鹽酸羥胺。典型例子有阿斯巴甜、果糖、檸檬酸、賴氨酸、酸水解植物蛋白等。這些工藝都使用食品級（非常純）的鹽酸羥胺。